腸内細菌は、微生物の複雑かつ多様なグループです。それらは、哺乳類-ヒトを含む-や昆虫などの他の動物の消化管での頻繁な位置にちなんで名付けられました（Tortora et al。2007）。
しかし、これらの細菌の存在は動物の世界に限定されず、植物（Cabello、2007）、土壌、さらには水中（Olivas、2001）でも病原体として発見されています。
大腸菌
技術用語によると、これらは「桿菌」と見なされます。この用語は、これらの生物の細長くてまっすぐで細い棒の形状を指します。さらに、それらはグラム陰性菌であり、細胞壁が薄く、さまざまな種類の脂質が豊富な二重膜を備えていることを示しています（Tortora et al。2007）。
臨床の観点から、人間に病気を引き起こす腸内細菌科のある種があるので、それらは徹底的に研究されてきました。ただし、すべてが病原性があるわけではありません。
たとえば、Escherichia coliは哺乳類の腸の最も一般的な生息地の1つであり、特定の株が有益です。実際、E.coliはビタミンを生成し、腸から他の有害な微生物を排除することができます（Blount、2015年）。
一般的な特性
腸内細菌科は自由生活細菌であり、胞子を形成せず、長さ0.3〜6.0 µm、直径0.5 µmの中間サイズです。その成長に最適な温度は37℃です。彼らは通性嫌気性です、すなわち、彼らは酸素のある環境で生きるか、またはそれなしで生きることができます。
鞭毛（鞭に似た突起で動きに使用される突起）があるものもあれば、運動のための構造がなく完全に動かないものもあります。
べん毛に加えて、これらの細菌は一般に、線毛および線毛として知られる一連の短い付属器を持っています。どちらも髪の毛に似ていますが、機能は異なります。
線毛は粘膜に付着するために使用される構造であり、性線毛は2つの生物間の遺伝物質の交換を可能にし、このプロセスの一種の架け橋として機能します（Tortora et al。2007）。
バクテリアが有性生殖をしないことは事実ですが、この出来事はDNAの交換を可能にします。レシピエント細菌によって獲得されたこの新しいDNA分子は、特定の抗生物質に対する耐性など、特定の特性を発達させることができます。
これは水平遺伝子導入として知られており、ほとんどのバクテリアで一般的であり、医学的に関連する意味があります。
いくつかの腸内細菌科は、多糖類で構成される追加の層で囲まれているのが一般的です。これはカプセルと呼ばれ、K抗原を持っています（Guerrero et al。、2014）。
分類
腸内細菌科は、約30属、約130を超える種、生物群、および腸管群で構成されています。ただし、分類順序を確立した作成者によっては、数が多少異なる場合があります。
これらの微生物の分類は、異なる代謝経路に属する特定の重要な酵素の有無を決定することに基づいています。同様に、グループの順序を確立するために、血清学的反応、特定の抗生物質に対する感受性または耐性などの他の原則が含まれています。
歴史的に、部族の分類学的カテゴリーは腸内細菌科の分類に使用されていました。これには、Escherichieae、Edwardsielleae、Salmonelleae、Citrobactereae、Klebsielleae、Proteeae、Yersinieae、およびErwiniaeaeの部族が含まれます。
ただし、別の著者によると、このビューはすでに廃止されており、破棄されています。この変更にもかかわらず、このグループの分類法は困難な議論の的となってきました（Winn、2006）。
近年、DNAハイブリダイゼーションおよびシーケンシング技術により、この異種の家族を構成する生物のより正確な分類を確立することが可能になりました。
腸内細菌科の分類と命名法の中で、グループの最も有名な属に言及することができます。
生化学検査
実験室では、生化学的検査は、人間や土壌、食品中の病原体を特定するために不可欠です。さまざまな生化学反応に対する微生物の反応は、タイピングを助ける特性を生み出します。
この細菌ファミリーの代謝の最も重要な特徴は次のとおりです。
-硝酸塩を亜硝酸塩に還元する能力、脱窒と呼ばれるプロセス（Pantoea agglomerans、SerratiaおよびYersiniaなどのいくつかの例外があります）。
-グルコースを発酵させる能力。
-オキシダーゼ試験に陰性、カタラーゼ試験に陽性、ペクチン酸もアルギン酸も液化しなかった（Gragera、2002; Cullimore、2010; Guerrero et al。、2014）。
-同様に、いくつかの病原性腸内細菌科は乳糖を発酵させません。
これらの微生物を同定するための最も一般的なテストには、アセチル-メチル-カルビノールの生産、メチルレッドのテスト、インドールの生産、クエン酸ナトリウムの使用、硫酸の生産、ゼラチンの加水分解、他の炭水化物の中でもとりわけ、尿素およびグルコース、ラクトース、マンニトール、スクロース、アドニトール、ソルビトール、アラビノースの発酵（Winn、2006; Cabello、2007）。
バクテリアの同一性を識別する最大の力を持っていると考えられるテストは、インドール生成、リジン脱炭酸酵素、H2S、およびオルニチン脱炭酸酵素です（García、2014）。
疫学
腸内細菌科は、さまざまな病状の原因物質です。最も一般的なのは、尿路感染症、肺炎、敗血症、および髄膜炎です。感染症の発生は主に患者の免疫系の状態に依存しますが。
医学的に重要な腸内細菌科の属の中で、最も関連性の高いものは次のとおりです。
-サルモネラ：汚染された食物や水によって伝染し、発熱、下痢、嘔吐を引き起こします。
-クレブシエラ：尿路感染症、下痢、膿瘍、鼻炎に関連しています。
-Enterobacter：髄膜炎および敗血症に関連付けられています。
セラチア：肺炎、心内膜炎、敗血症を引き起こします。
プロテウス属のいくつかは、胃腸炎を引き起こします。
シトロバクターは、病気の患者に尿路や気道の感染症を引き起こします。
治療
これらの細菌性病原体の治療は非常に複雑であり、患者の初期状態やこれが示す症状など、さまざまな要因に依存します。
有害物質である腸内細菌科は、一般に、キノロン、アンピシリン、セファロスポリン、アモキシシリンクラブラン酸、コトリモキサゾールなどの特定の抗生物質に感受性があり、一部はテトラサイクリンに感受性です。
抗生物質を無差別に使用すると、抗生物質に耐性のある細菌の頻度が増えることに注意してください。これはデリケートな地球規模の健康問題と見なされ、論理的には治療の割り当てを妨げます。
たとえば、一部の腸内細菌科はカルバペネマーゼに耐性があるという事実は治療を大幅に妨害し、最も簡単な実行可能な解決策は、チゲサイクリンやコリスチンなどのいくつかの抗生物質を組み合わせた治療を適用することです（Falagas et al。、2013）（Guerreroら、2014）。
最近の研究では、アミノグリコシド、ポリミキシン、ホスホマイシン、テモシリンの使用が示唆されています（Van Duin、2013）。
参考文献
- ブラウント、ZD（2015）。モデル生物の自然史：大腸菌の枯渇していない可能性。Elife、4、e05826。
- カベロ、RR（2007）。人間の微生物学と寄生虫学。感染症および寄生虫症の病因基盤。パンアメリカンメディカルエド
- カリモア、DR（2010）。細菌同定のための実用的なアトラス。CRCプレス。
- Falagas、ME、Lourida、P.、Poulikakos、P.、Rafailidis、PI、およびTansarli、GS（2013）。カルバペネム耐性腸内細菌科による感染症の抗生物質治療：利用可能な証拠の系統的評価。抗菌剤と化学療法、AAC-01222。
- García、P.&Mendoza、A.（2014）。腸内細菌科の手動同定のための伝統的で高解像度の生化学的試験。ラテンアメリカ臨床生化学アクタ、48（2）、249-254。
- Gragera、BA（2002）。腸内細菌感染症。医学認定の継続医学教育プログラム、8（64）、3385-3397。
- ゲレーロ、PP、サンチェス、FG、サボリド、DG、およびロザノ、IG（2014）。腸内細菌感染症。医学認定の継続医学教育プログラム、11（55）、3276-3282。
- Olivas、E.（2001）。基本的な微生物学研究室マニュアル。スポーツトレーニングプログラム。UACJ。
- Tortora、GJ、Funke、BR、&Case、CL（2007）。微生物学の紹介。Panamerican Medical Ed。
- Van Duin、D.、Kaye、KS、Neuner、EA、&Bonomo、RA（2013）。カルバペネム耐性腸内細菌科：治療と転帰のレビュー。診断微生物学および感染症、75（2）、115-120。
- ウィン、WC（2006）。コネマンのカラーアトラスと診断微生物学の教科書。リッピンコットウィリアムズ&ウィルキンス。