コドンは、核酸を構成する4つに基づいて、3個のヌクレオチドの64個の可能な組み合わせのそれぞれです。つまり、4つのヌクレオチドの組み合わせから、3つの「文字」のブロック、つまりトリプレットが作成されます。
これらは、DNAに窒素塩基のアデニン、グアニン、チミン、およびシトシンを持つデオキシリボヌクレオチドです。RNAでは、それらは窒素塩基アデニン、グアニン、ウラシル、およびシトシンを持つリボヌクレオチドです。
コドンの概念は、タンパク質をコードする遺伝子にのみ適用されます。DNAエンコードされたメッセージは、メッセンジャーからの情報が処理されると、3文字のブロックで読み取られます。つまり、コドンは翻訳される遺伝子の基本的なコーディング単位です。
コドンとアミノ酸
3文字の単語の各位置に4つの可能性がある場合、製品4 X 4 X 4は64の可能な組み合わせを提供します。これらのコドンのそれぞれは、特定のアミノ酸に対応します-読み取り終了コドンとして機能する3つを除く。
核酸の窒素含有塩基でコード化されたメッセージからペプチドのアミノ酸含有メッセージへの変換は、翻訳と呼ばれます。DNAから翻訳部位にメッセージを移動させる分子は、メッセンジャーRNAと呼ばれます。
メッセンジャーRNAのトリプレットは、翻訳がリボソームで行われるコドンです。ヌクレオチドの言語をリボソームのアミノ酸に変える小さなアダプター分子はトランスファーRNAです。
メッセージ、メッセンジャー、翻訳
タンパク質をコードするメッセージは、3の倍数であるヌクレオチドの線形配列で構成されます。メッセージは、メッセンジャー(mRNA)と呼ばれるRNAによって運ばれます。
細胞生物では、すべてのmRNAは、それぞれのDNAのコードされた遺伝子の転写によって発生します。つまり、タンパク質をコードする遺伝子は、DNAの言語でDNAに書かれています。
ただし、これはこの3つの規則がDNAで厳密に守られていることを意味するものではありません。DNAから転写されたメッセージは現在、RNA言語で書かれています。
mRNAは、遺伝子メッセージを持つ分子で構成され、両側に非コード領域が隣接しています。たとえばスプライシングなどの特定の転写後の変更により、3つのルールに準拠したメッセージを生成できます。この3つの規則がDNAで満たされていないように思われる場合は、スプライシングによって復元されます。
mRNAはリボソームが存在する部位に輸送され、ここでメッセンジャーはメッセージのタンパク質言語への翻訳を指示します。
最も単純なケースでは、タンパク質(またはペプチド)は、メッセージの文字の3分の1に相当する数のアミノ酸を3つ含まずに持つことになります。つまり、メッセンジャーコドンの数から終了の1つを引いた数に等しくなります。
遺伝メッセージ
タンパク質をコードする遺伝子からの遺伝的メッセージは、一般に、アミノ酸メチオニン(RNAではコドンAUG)として翻訳されるコドンで始まります。
次に、特徴的な数のコドンが特定の直線の長さと配列で続き、停止コドンで終わります。停止コドンは、オパール(UGA)、アンバー(UAG)、または黄土色(UAA)コドンのいずれかです。
これらはアミノ酸言語で同等のものがないため、対応するトランスファーRNAはありません。しかしながら、いくつかの生物では、コドンUGAは修飾アミノ酸セレノシステインの取り込みを可能にします。他のものでは、コドンUAGはアミノ酸ピロリシンの取り込みを可能にします。
メッセンジャーRNAはリボソームと複合体を形成し、翻訳の開始により最初のメチオニンの取り込みが可能になります。プロセスが成功すると、メッセンジャーによって導かれる対応するアミノ酸が各tRNAから提供されるため、タンパク質が伸長(伸長)します。
終止コドンに到達すると、アミノ酸の取り込みが停止し、翻訳が完了し、合成されたペプチドが放出されます。
コドンとアンチコドン
これははるかに複雑なプロセスの簡略化ですが、コドンとアンチコドンの相互作用は、相補性による翻訳の仮説をサポートします。
これによれば、メッセンジャーの各コドンについて、特定のtRNAとの相互作用は、アンチコドンの塩基との相補性によって決定されます。
アンチコドンは、典型的なtRNAの環状塩基に存在する3つのヌクレオチド(トリプレット)のシーケンスです。特定の各tRNAには、常に同じである特定のアミノ酸をロードできます。
このようにして、アンチコドンが認識されると、メッセンジャーはリボソームに、そのフラグメントで相補的であるtRNAを運ぶアミノ酸を受け入れる必要があることを伝えます。
したがって、tRNAは、リボソームによって実行される翻訳を検証できるようにするアダプターとして機能します。このアダプターは、3文字のコドン読み取りステップで、最終的に翻訳されたメッセージを構成するアミノ酸の線形取り込みを可能にします。
遺伝暗号の変性
コドン:アミノ酸の対応は、生物学では遺伝暗号として知られています。このコードには、3つの翻訳停止コドンも含まれています。
20の必須アミノ酸があります。ただし、変換に使用できるコドンは64個あります。3つの終止コドンを削除しても、アミノ酸をコードする残りの61が残っています。
メチオニンは、開始コドンであるAUG-コドンによってのみコード化されますが、メッセージ(遺伝子)の他の部分のこの特定のアミノ酸によってもコード化されます。
これにより、残りの60個のコドンに19個のアミノ酸がコードされています。多くのアミノ酸は単一のコドンによってコードされています。ただし、複数のコドンによってコードされる他のアミノ酸があります。このコドンとアミノ酸の関係の欠如は、私たちが遺伝暗号の縮退と呼んでいるものです。
オルガネラ
最後に、遺伝暗号は部分的に普遍的です。真核生物には、細胞質で確認されているものとは異なる翻訳が確認されている他のオルガネラ(進化的には細菌に由来)があります。
独自のゲノム(および翻訳)を持つこれらのオルガネラは、葉緑体とミトコンドリアです。葉緑体、ミトコンドリア、真核生物の核、細菌の核様体の遺伝暗号は完全に同一ではありません。
ただし、各グループ内では普遍的です。たとえば、動物細胞でクローン化および翻訳された植物遺伝子は、起源の植物で翻訳された場合と同じ線形アミノ酸配列を持つペプチドを生成します。
参考文献
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